The relevance of genotyping and subtyping of BVDV in assessing the epizootic process

Currently, most pathogens of respiratory diseases have a wide variability in the genetic structure and are represented by a wide variety of genetic types. Bovine viral diarrhea virus (BVDV) has the greatest genetic variability among pathogens of cattle respiratory infections. BVDV is divided into 2 genotypes recognized as independent species: BVDV 1 (20 subtypes, la -1t) and BVDV 2 (5 subtypes, 2a-2e), part of the isolates, called HOBI-like viruses, were attributed to the third type - BVDV 3. In order to effectively control bovine viral diarrhea, it is necessary to have information about the virus subtypes that circulate in the region, as well as the dynamics of the spread of the pathogen. Our previous studies confirmed the circulation of infectious BVDV among the breeding stock, intrauterine transmission of the virus to the fetus and the presence of virus carriers in farms in the Ural region. BVDV isolates from 6 samples of biological material from infected animals were isolated, the creation of a base of BVDV field isolates for subsequent genotyping and studying their biological characteristics continues. For further studies, we selected specific primers. The complementarity and specificity of the selected primers were evaluated by comparing with the base of the NCBI nucleotide sequences using the BLAST algorithm for searching for related sequences. The homology of the selected primers with sequences of strains and isolates of cattle viral diarrhea virus has been established.

крупный рогатый скот, острые респираторные инфекции, вирусная диарея крупного рогатого скота, ПЦР, праймеры, генетическая структура, cattle, bovine respiratory disease, bovine viral diarrhea, PCR, primers, genetic structure

1. Артюхова Е.Е. Вирусная диарея - болезнь слизистых, проблема российского скотоводства/ Е.Е. Артюхова, О.Г. Губенко, Е.С. Кострова// Достижения молодых ученых - в вет. практику: материалы 4 -й Междунар. науч. конф., посвящ. 55-летию аспирантуры ФГБУ "ВНИИЗЖ". 2016. С. 206-213.

2. Вялых И.В. Мониторинг заболеваемости крупного рогатого скота вирусной диареей в Уральском регионе/ И.В. Вялых, А.П. Порываева, Е.Н. Шилова// Эколого-биологические проблемы использования природных ресурсов в сельском хозяйстве. Материалы Международной научно -практической конференции молодых ученых и специалистов. 2017. С. 166-169.

3. Кунгурцева О.В. Особенности распространения вирусной диареи-болезни слизистых оболочек крупного рогатого скота, молекулярно-биологические свойства изолятов вируса// Автореф. дисс.. канд. биол.наук. - Новосибирск, 2010. - 22с.

4. Левченко С.В. Иммунобиологические свойства вакцинного штамма «Nadl-ВНИИЗЖ» вируса вирусной диареи крупного рогатого скота/ С.В. Левченко и др.// Труды Федерального центра охраны здоровья животных. Т. VIII. 2010. С. 98-107.

5. Методы клинико-лабораторной диагностики острых респираторных вирусных инфекций у крупного рогатого скота/ А.П. Порываева и др.// Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии. - 2017. - №3. - С.55-58.

6. Нефедченко А.В. Комплексная система диагностики и генетического типирования ведущих возбудителей респираторных болезней крупного рогатого скота на основе методов молекулярной биологии в современных условиях ведения молочного животноводства// Автореф. дисс.. докт. вет.наук. - Краснодар, 2018. - 41с.

7. Острые респираторные заболевания крупного рогатого скота и проблемы профилактики в современных условиях промышленного производства / Е.Е. Артюхова и др.// Аграрный вестник Урала. 2013. № 10 (116). С.25-27.

8. Патогенность нецитопатогенных изолятов вируса вирусной диареи-болезни слизистых оболочек для серонегативных телят/ А.Г. Глотов и др.// Вопросы вирусологии. 2014. №4 (59). С.46-49

9. Прасолова О.В. Молекулярно-генетический анализ возбудителя вирусной диареи крупного рогатого скота в хозяйствах северо-западного региона РФ// Автореф. дисс.. канд. вет.наук. -Санкт-Петербург, 2017. - 18с.

10. Сухинин А.А. Генетическое типирование вируса вирусной диареи крупного рогатого скота/ А.А. Сухинин, С.А. Макавчик, О.В. Прасолова// 7 Ежегодный Всероссийский Конгресс по инфекционным болезням с международным участием. Сборник материалов. Москва. 2015. том 13. С. 326- 327.

11. Характеристика генома и белков возбудителя вирусной диареи крупного рогатого скота/ П.П. Красочко// Ученые записки учреждения образования «Витебская ордена «Знак Почета» государственная академия ветеринарной медицины»: научно-практический журнал. - Витебск, 2011. -Т. 47, вып. 1. - С. 64-67.

12. Шилова Е.Н. Вирусная диарея - болезнь слизистых оболочек крупного рогатого скота в Уральском регионе / Шилова Е.Н., Ряпосова М.В., Шкуратова И.А., Вялых И.В. // Ветеринария. 2014. № 5. С. 19-21.

13. Fulton R.W. Bovine respiratory disease research (1983-2009)/ R.W. Fulton// Anim Health Res Rev. 2009. 10(2):131-139.

14. Genotyping of bovine viral diarrhea viruses from cattle in China between 2005 and 2008/ F. Xue et al.// Vet Microbiol. 2010.143(2-4):379-383.

15. Giangaspero M. Numerical taxonomy of the genus Pestivirus based on palindromic nucleotide substitutions in the 5' untranslated region/ M. Giangaspero, R. Harasawa// J Virol Methods. 2007. 146 (1-2). 375-388.

16. Identification of new genetic subtypes of bovine viral diarrhea virus genotype 1 isolated in Japan/ Nagai M et al.// Virus Genes. 2008. 36(1):135-139.

17. Neill J.D. Molecular biology of bovine viral diarrhea virus/ J.D. Neill// Biologicals. -2013. -Vol. 41. -P. 2-7.

18. Prevalence study and genetic typing of bovine viral diarrhea virus (BVDV) in four bovine species in China/ Deng M et al.// PLoS One. 2015.10(4).

19. Ridpath J. The contribution of infections with bovine viral diarrhea viruses to bovine respiratory disease/ J. Ridpath// Vet Clin North Am Food Anim Pract. 2010. 26(2). 335-348.

20. Ryaposova M.V.Bovine viral diarrhea of cattles in the Ural region / Ryaposova M.V., Shilova E.N. // Reproduction in Domestic Animals. 2014. Т. 49. № 3. С. 92.

21. Shilova E.N. Clinical implications of bovine viral diarrhoea in breeding enterprises of the Ural region/ E.N. Shilova, I.V. Vyalykh//Science & Education. 2013. Т. 22. № 1. С. 179-182.